實時熒光定量PCR儀百科知識
1. 定義與概述
實時熒光定量PCR儀(Real-Time Quantitative PCR, qPCR)是一種基于聚合酶鏈式反應(PCR)技術,通過熒光信號實時監測DNA擴增過程的高精度分子生物學儀器。
核心功能:
定量檢測DNA/RNA的初始模板量(絕對定量或相對定量)。
檢測基因表達水平、病原體載量、基因突變等。
廣泛應用于疾病診斷、基因研究、食品安全檢測等領域。
2. 核心技術原理
熒光標記機制:
TaqMan探針法:探針帶有熒光基團和淬滅基團,擴增時探針水解釋放熒光。
SYBR Green法:染料嵌入雙鏈DNA發出熒光,成本低但特異性稍差。
分子信標(Molecular Beacon):莖環結構探針,靶序列結合后發光。
檢測模式:
終點法:僅檢測最終產物量。
實時法:通過Ct值(閾值循環數)動態分析擴增曲線,實現精準定量。
3. 核心參數與性能指標
參數 | 意義 | 典型范圍/要求 |
---|---|---|
檢測通道數 | 支持多色熒光檢測能力(如FAM, HEX, ROX) | 1-6通道(多用于多重PCR) |
靈敏度 | 最低可檢測DNA拷貝數 | 單拷貝(<10 copies/μL) |
溫控精度 | 溫度均一性和升降溫速率 | ±0.1°C,升降溫≥4°C/秒 |
動態范圍 | 線性定量范圍(Log值) | 7-8個數量級(10^1~10^8拷貝) |
4. 主要應用場景
臨床診斷:
病毒/細菌核酸檢測(如新冠病毒、HPV、結核分枝桿菌)。
腫瘤基因突變檢測(EGFR、KRAS等)。
科研領域:
基因表達分析(mRNA定量)。
miRNA檢測、SNP分型。
農業與食品:
轉基因成分鑒定。
食源性致病菌(如沙門氏菌)快速檢測。
5. 與傳統PCR的對比
特性 | 實時熒光定量PCR | 傳統PCR |
---|---|---|
定量能力 | 實時監測,精準定量(基于Ct值) | 僅終點定性/半定量(電泳分析) |
檢測速度 | 1-2小時(含數據分析) | 2小時+額外電泳時間 |
污染風險 | 閉管操作,污染風險低 | 開蓋電泳,易污染 |
成本 | 較高(熒光試劑/探針) | 低 |
6. 操作流程與注意事項
標準流程:
樣本制備:提取DNA/RNA并反轉錄為cDNA(RNA檢測時)。
反應體系配制:加入引物、探針、模板、Taq酶等。
程序設置:設定擴增程序(預變性→循環擴增→熔解曲線分析)。
數據分析:通過軟件計算Ct值,生成標準曲線或相對表達量。
關鍵注意事項:
避免RNA降解(使用RNase抑制劑)。
防止交叉污染(分區操作、UNG酶防殘留)。
驗證引物特異性(熔解曲線單峰)。
7. 主流品牌與型號
品牌 | 代表型號 | 特點 |
---|---|---|
Bio-Rad | CFX96 | 高性價比,5通道檢測,適合中小型實驗室 |
Thermo Fisher | QuantStudio 5 | 模塊化設計,支持高通量(384孔板) |
Roche | LightCycler 480 | 超快升降溫(19°C/秒),精準溫控 |
Qiagen | Rotor-Gene Q | 離心式溫控,均一性好,適合低濃度樣本 |
8. 未來發展趨勢
數字化PCR(dPCR):通過微滴分區實現絕對定量,無需標準曲線。
便攜化設備:手持式qPCR儀(如BioFire FilmArray)用于床邊檢測。
AI整合:自動優化引物設計、智能分析擴增異常曲線。
多重檢測升級:支持10+靶標同步檢測(如病原體panel篩查)。
9. 常見問題(FAQ)
Q:是否必須做標準曲線?
A:絕對定量需要標準品繪制曲線;相對定量(如2^-ΔΔCt法)可不依賴標準曲線。Q:熔解曲線出現多峰怎么辦?
A:可能為引物二聚體或非特異擴增,需優化引物濃度或退火溫度。Q:如何提高低濃度樣本的檢測靈敏度?
A:增加模板體積、使用高靈敏度探針(如TaqMan MGB)、減少抑制劑干擾。
總結
實時熒光定量PCR儀憑借高靈敏度、快速定量、閉管防污染等優勢,已成為分子診斷和基因研究的核心技術平臺。隨著數字化、微流控等技術的融合,其在精準醫學和即時檢測(POCT)中的應用將更加廣泛。
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